轻松搞懂 PCR、qPCR、RT-PCR、RT-qPCR
在生命科学的研究领域中,PCR、qPCR、RT-PCR、RT-qPCR 这些术语常常出现,它们名字相似,却有着不同的特点和用途。今天,就让我们一起来轻松搞懂它们。
一、PCR:开启基因扩增的大门
PCR,即聚合酶链式反应,是美国科学家 Kary B. Mullis 在 1985 年发明的一项伟大技术,他也因此在 1993 年获得了诺贝尔化学奖。PCR 就像是一个神奇的“复印机”,能够在体外快速扩增特定的 DNA 片段。
它的原理并不复杂,主要包括三个基本步骤:高温变性、低温退火和适温延伸。在高温(95℃左右)下,双链 DNA 模板的氢键断裂,解链变成单链 DNA;接着温度降至 55 – 60℃,引物与模板 DNA 单链按碱基互补配对的原则结合;最后温度调至 72℃左右,DNA 聚合酶以 dNTP 为原料,从引物的 3′端开始合成一条新的与模板 DNA 链互补的 DNA 链。通过多次循环,微量的 DNA 片段就能在短时间内扩增到足够数量。
PCR 技术自问世以来,在生物科学、分子诊断、亲子鉴定、法医鉴定等众多领域都发挥了巨大作用。扩增完成后,通常借助凝胶电泳对扩增出来的 DNA 进行检测和分析。
二、qPCR:让定量分析更精准
qPCR 也就是实时荧光定量 PCR,它是 PCR 技术的升级版,属于第二代 PCR 技术。qPCR 的特别之处在于,在整个扩增过程中引入了荧光染料或者荧光基团。随着 DNA 数量的成倍增加,反应体系中的荧光信号也会增强。通过检测荧光信号的强弱,就能实时监测每一个循环中扩增产物量的变化,最后通过标准曲线和 CT 值对待测样品进行定量分析。
qPCR 常用的荧光方法有两种。一种是 SYBR Green 法,SYBR GreenⅠ染料能与所有的双链 DNA 结合,结合后显示荧光信号,荧光强度与双链 DNA 的量呈正比。另一种是 TaqMan 探针法,根据目的基因设计特异性的荧光探针,正常情况下荧光基团的荧光被淬灭基团抑制,扩增时探针结合到 DNA 模板上并被切开,荧光基团发出荧光。
qPCR 操作简便,灵敏度高,重复性好,在临床医学检验和食品安全检测等领域迅速发展,成为许多病原微生物诊断的金标准。
三、RT-PCR:从 RNA 到 DNA 的转变
RT-PCR 即逆转录 PCR,它是 PCR 的一种变形。在生物体内,遗传信息通常是从 DNA 转录为 RNA,而 RT-PCR 则是反其道而行之,先将 RNA 链逆转录成为互补 DNA(cDNA),再以 cDNA 为模板进行 PCR 扩增。
RT-PCR 主要用于 RNA 分子的扩增和检测,比如研究基因的转录水平。它可以对 RNA 进行定性检测,但无法进行定量分析。
四、RT-qPCR:结合逆转录与定量分析
RT-qPCR 是逆转录实时定量 PCR,它巧妙地结合了 RT-PCR 和 qPCR 的技术。首先通过反转录酶将 RNA 逆转录成 cDNA,然后利用 qPCR 技术对 cDNA 进行定量分析。
RT-qPCR 能够对 RNA 分子进行精确的定量,在基因表达分析、病毒载量检测等方面有着广泛的应用。例如,在新冠疫情期间,RT-qPCR 技术就被大量用于检测新冠病毒的核酸,为疫情防控提供了重要的技术支持。
五、总结
PCR 是基础,为后续的技术发展奠定了基石;qPCR 在 PCR 的基础上实现了定量分析,让结果更加准确;RT-PCR 则为研究 RNA 提供了途径;RT-qPCR 结合了两者的优势,能够对 RNA 进行精准的定量。
希望通过今天的介绍,大家能对 PCR、qPCR、RT-PCR、RT-qPCR 有更清晰的认识,在未来的科研道路上,能够根据实际需求选择合适的技术方法。